Административный отдел
Осуществляет общее руководство, стратегическое планирование, кадровый учет, правовое и финансово-экономическое обеспечение деятельности библиотеки.
Отдел комплектования, каталогизации и обработки документов
Отвечает за пополнение библиотечного фонда новыми изданиями, научную обработку поступивших книг и ведение электронного и карточного каталогов.
Отдел абонемента (с сектором регистрации и контроля пользователей)
Занимается записью пользователей, оформлением читательских билетов, выдачей литературы на дом и контролем использования фонда.
Научно-методический отдел
Осуществляет координацию и методическую поддержку публичных библиотек Республики Абхазия, разрабатывает профессиональные руководства, организует семинары и повышение квалификации специалистов.
Отдел основного книгохранения (с сектором редких книг)
Обеспечивает надежное хранение, учет и сохранность основного многотысячного фонда библиотеки, а также уникальных, редких и ценных изданий.
Отдел иностранной литературы
Формирует фонд книг и периодических изданий на иностранных языках, оказывает помощь в поиске зарубежных информационных и образовательных ресурсов.
Отдел книжной палаты
Обеспечивает государственный архивный учет и хранение обязательного экземпляра всех печатных изданий, выпускаемых на территории Республики Абхазия.
Отдел читального зала (с сектором периодики и справочно-библиографической службы)
Организует работу читальных залов, предоставляет доступ к текущей и архивной периодике, выполняет тематические и библиографические запросы читателей.
Отдел краеведческой и национальной литературы
Ключевое звено в сохранении культурного наследия. Отдел собирает, бережно хранит и исследует литературу, посвященную истории, языку, культуре и традиции Абхазии.
Отдел информационных технологий и оцифровки
Занимается цифровизацией печатных фондов и архивной прессы, формированием Национальной электронной библиотеки, а также технической поддержкой автоматизированных систем и сайта.